Çeşitli özel uygulamalar, çok farklı motor tasarımları, topolojileri ve yapıları gerektirmektedir. Özel uygulamalar için piyasada motor temini mümkün olmamaktadır. Mekatro, esnek tasarım yeteneğiyle bu sektöre çeşitli prototipler sunmaktadır. Kimi zaman çok yüksek verim, kimi zaman yüksek moment gibi özel istekler ana hedefler olabilmektedir. Bu hedefler klasik motor tasarımlarını terk ederek özel yapılara yönelmeyi getirmektedir. Mekatro tasarımı özel motorlar her türlü standarda uygun olacak şekilde tasarlanıp imal edilebilmektedir.